随着中国加入 WTO，WTO的关税减让、国民待遇、市场准入原则的实施将使保税区与非保税区的政策 “落差”大大缩小。入世后保税区虽可以继续保持其特殊的关税政策，但作为统一适用与实施 WTO协议及中国《加入世界贸易组织议定书》项下义务的中国关境内的一个 “特别经济区域”，与其有关的法律法规还存在许多问题。入世后，中国的保税区不但不会消亡，相反，由于与 WTO的自由贸易制度接轨，而将变得更加规范，成为 “境内关外”真正意义上的国际通行的自由贸易区。